乔纳森·贝利并非生于戏剧家庭,他曾梦想着做一名老师,但他小时候对伦敦剧院的访问引起了他的演艺兴趣,以及在他的三个姐姐对他的影响下,他从此开始戏剧生涯。他曾在故事剧《诺亚方舟》中扮演雨滴。1992年,他曾扮演过牧羊人。1993年,他在观看了英国戏剧《雾都孤儿》后便立志做一名演员。乔纳森并没有上过大学,也没有上过戏剧学校。
家庭乔纳森·贝利出生于英国牛津郡艾尔斯伯里谷的本顿村。他的父亲是前Rowse蜂蜜董事总经理斯图尔特·贝利,他在放弃了DJ的职业之后,在Rowse蜂蜜工厂稳定工作；他的母亲是一名听力学家；他的家中还有三位姐姐。友人他是英国演员,编剧,制片人菲比·沃勒-布里奇的好朋友；他也是演员休·斯金纳的朋友,曾与他共同出演电视剧《W1A》；他还是凯蒂·布莱本的好朋友,曾与她一同出演音乐剧《美国精神病人》。运动他平日里会参加铁人三项比赛,悬挂在攀岩墙上并在意大利徒步旅行。为了保持身材,他会进行桨板冲浪并在海里游泳。2015年4月26日,在2015年伦敦马拉松比赛上取得5点22分25秒的成绩。性取向乔纳森·贝利是一名公开出柜的同性恋,他在20多岁时向朋友和家人出柜。
2019年4月7日,乔纳森·贝利在第43届劳伦斯·奥利弗奖颁奖典礼上发表获奖感言时,强调LGBT在艺术中的重要性,以此回应在英国伯明翰和其他地方的学校中,有关LGBT课程的争议,此举得到英国校园的关注。2020年12月,在受到英剧《急诊室的故事》中关于同性恋死于艾滋病的剧情影响下,乔纳森·贝利对社会中有关电视和电影演员及性取向的相关争论表示了自己的看法,并承认他希望看到更多男同性恋演员扮演同性恋角色。