高旗生长在音乐世家,他的父母均毕业于中央音乐学院。虽然高旗的父母并未强迫他学习钢琴及其它乐器,但在他3岁时,父亲带他去看了《茶花女》,此时幼小的高旗已经能感受到音乐中的悲剧气氛而默默流泪。中学时,高旗开始学吉它。这个时期的他在母亲的影响下接触了不少西洋音乐和中外的文学作品。因此,高旗大多数时间都将心力投注在写诗和散文写作上。高中时,高旗因参加吉他大奖赛而结识了曹平,曹均两兄弟,由此踏上了摇滚之路。1986年,高旗考入北京联大旅游学院；在大学期间,高旗因为醉心音乐学习成绩亮起了红灯；最终他与父亲商量后决定申请退学,从而专注于音乐创作上。
家庭高旗的父亲高伟是一名合唱指挥,他毕业于中央音学院指挥系。他的母亲亦于中央音乐学院主修钢琴并毕业于音乐系,其后任职于美国国家影艺学院。婚姻高旗赛车1996年10月,高旗与模特陈娟红相识,后对其展开追求。2002年底,高旗与陈娟红在北京举行了简单的婚礼。爱好高旗的业余爱好是足球和赛车,他是梦舟明星俱乐部足球队的前锋,号码为18号。1993至1997年任副队长。2004年11月,高旗被选中参加国际爱果士冰上汽车大赛,并前往法国参加试训。
2005年7月1日,高旗随超载乐队参加了“红色摇滚之夜·纪念世界反法西斯战争胜利60周年公益演唱会”,并与黑豹,零点等12支乐队同台演唱歌曲《保卫黄河》。2006年10月15日,高旗参加了“长安福特名人慈善赛”,并获得男子组亚军；11月17日,与丁薇,羽泉等歌手参加了“爱心2008·中国有我”公益宣传活动晚会。2008年5月,“5·12汶川地震”发生后,高旗创作了抗震救灾爱心歌曲《要你坚强》为灾区加油,以此鼓励灾区人民要振作起来；5月25日,与吴京,陈娟红等人加入梦舟明星赛车队,并参加以抗震救灾为主题的“壹基金”杯慈善房车赛活动。2010年4月25日,“4·14玉树地震发生后,高旗与韩红,羽泉等众多艺人响应号召加入“演艺界情系玉树关爱行动大汇演”,并参与录制了内地版赈灾歌曲《手连心》。